原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

在未來科學(xué)家制造了“盤古”這臺(tái)毀壞力超強(qiáng)的戰(zhàn)爭(zhēng)機(jī)器。公元2139年世界大戰(zhàn)爆發(fā)，“盤古”被用于戰(zhàn)爭(zhēng)。 世界大戰(zhàn)結(jié)束后，盤古被銷毀。 然而戰(zhàn)爭(zhēng)結(jié)束16年后，盤古神秘復(fù)活，并有自己的思想，覺得自己當(dāng)年被遺棄，懷恨在心，決定復(fù)仇人類，自己制造出具有行動(dòng)能力的機(jī)器，并開始大量制造各種戰(zhàn)爭(zhēng)機(jī)器人，開始報(bào)復(fù)人類，大舉進(jìn)攻人類。

撥開重重的殺人謎案，顯露出來的便是唯一的真相，當(dāng)事實(shí)被一點(diǎn)點(diǎn)挖掘，推理出的竟然是人心。自古英雄男兒，紅顏多少神傷，女人的悲歌能否戛然而止，同時(shí)在陽光下肆意生長(zhǎng)著的，還有那段純真的風(fēng)云緣。 傳承毒術(shù)的女人們更是被人們所誤解，在風(fēng)起云涌的皇室權(quán)力爭(zhēng)奪中，探案師與毒娥的終極對(duì)決展開了。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據(jù)現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時(shí)代，述寫新的傳奇。作品獨(dú)創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關(guān)系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭(zhēng)，此所謂“魂戰(zhàn)紀(jì)”。