一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統(tǒng)續(xù)作，一克帝國一統(tǒng)十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區(qū)的東伐西討、南征北戰(zhàn)，以及探秘發(fā)現(xiàn)未知區(qū)域及其他國度的奇幻旅程（根據(jù)小說一克帝國異域志內(nèi)容改編而成）。

比喻了一位名叫山脈的少年率領(lǐng)離子化、紡錘形、射電、羽毛、蝴蝶和仙組成了光弧教練的光之隊(duì)在宇宙星之飛球大賽的過程，從中遇到了由牙率領(lǐng)的金之隊(duì)、拱心環(huán)率領(lǐng)的獸之隊(duì)、藍(lán)離散率領(lǐng)的矢之隊(duì)等等并與光之隊(duì)決斗著，最終得到了冠軍。

天才少年林合在參加平南省少年乒乓球錦標(biāo)賽時(shí)，遭受好朋友的背叛和陷害，而決心退出乒乓球運(yùn)動(dòng)的生涯。而在此時(shí)卻遇到了校痞曹斌，而重燃熱情，向新的目標(biāo)開始迸發(fā)的熱血故事。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

三千位面管理者女主神綾清玄意外死亡，為了尋回生命和記憶，必須不斷穿越位面，攻略位面中的反派男主，阻止其黑化。為了把小黑蓮男主染回小白蓮，女主神用她的實(shí)際行動(dòng)告訴圍繞在男主身邊的妖艷賤貨們：無論哪個(gè)世界，你爸爸還是你爸爸！