主角為查明烈凌市的狀況，前來烈凌市烈日學(xué)院讀大學(xué)，不料遭遇各種不速之客來襲，為守護烈日學(xué)院的安寧，與伙伴們殊死搏斗，想要變得更強的主角甚至拜師習(xí)武，通過艱難的磨練，最終達到武術(shù)的巔峰。

故事在廢土風(fēng)格基礎(chǔ)上架構(gòu)了一個極具頹廢氣息的末世界，具有魔族血統(tǒng)被視為異類的主角在爾虞我詐的世界里，希冀去實現(xiàn)自己近乎渺茫的理想——擁有一位真正的朋友。在主角的任務(wù)過程中，偶然結(jié)識到的一位伙伴正逐步打開著主角的心扉。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。

一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統(tǒng)續(xù)作，一克帝國一統(tǒng)十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區(qū)的東伐西討、南征北戰(zhàn)，以及探秘發(fā)現(xiàn)未知區(qū)域及其他國度的奇幻旅程（根據(jù)小說一克帝國異域志內(nèi)容改編而成）。