原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

小學老師安傾時隔九年與初戀對象易言城再次相遇。當年因為一次滑雪的意外，易言城成為了間接害死自己姐姐安妮的兇手，安傾雖然只身離開這座城市，但依然沒有放下對他的感情。重遇時他已是成功的上市公司總裁，兩人間如同往日般的默契再加上自己的學生趙奇奇的有意撮合之下，他們很快又再次走到了一起。然而阻擋在安傾戀愛之路上的還有很多阻礙，未婚妻葉小姐，家人的不接受，如同巨石一般壓在她的心頭，一次又一次的擾亂她的生活。