明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

自從人類發(fā)現(xiàn)上層大陸并大舉遷移，被留在暗夜大陸的人們只能在黑暗種族的壓迫下艱難求生。主角萬流童年時家鄉(xiāng)被血族屠遍，全村僅有萬流一人逃過一劫，萬流立誓復(fù)仇。可他的仇人竟是黑暗種族中萬年一見的天才加爾威廉！ 萬流并未因此氣餒，哪怕面對常人難以承受的磨練，哪怕遭遇陷害身陷絕境，哪怕孤身對抗來自人類與黑暗種族兩方的壓迫也絕不放棄。突破！變強！直抵帝君之位！為了復(fù)仇，也為了改變這混亂的世界！