很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時，一位仙人出現(xiàn)，他將妖獸引領(lǐng)到一個世外秘境，這個秘境被后人稱之為“山海界”。 數(shù)百年過去了，某一天仙人設(shè)下的結(jié)界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現(xiàn)任守界者靈發(fā)仙人來到人類的世界。然而此時此刻，孟然和同學(xué)正因?yàn)檎`闖后山而遇到傳說中的兇獸窮奇……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

云清觀有一名能讓其師父聞風(fēng)喪膽的呆萌道士，天天以學(xué)術(shù)詢?nèi)耍鞣N問題層出不窮，簡直是十萬個為什么...這人就是楊修慕。他每天老老實(shí)實(shí)踏踏實(shí)實(shí)的修行捉妖，卻在某一天，成了這只小老鼠精的俘虜！老鼠陰險狡詐，他當(dāng)然不是對手，輕松的就交上了自己的心...