明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

丞相千金李令瞳一夜之間淪為罪臣之女，被剝奪準(zhǔn)太子妃身份，貶成奴仆關(guān)押在親戚家，飽受欺凌。遠(yuǎn)在邊疆的青梅竹馬、關(guān)押審訊的親爹、失蹤的老弟，內(nèi)憂外患的她卻又被賣給了權(quán)傾朝野的妖孽太監(jiān)——宮司墨。原以為自己會被虐待，對方卻將自己視若珠寶地圈養(yǎng)起來，時不時懇請她讓自己喝點(diǎn)血什么的

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

武道，決定命運(yùn)，決定生死，弱者，受人欺凌，強(qiáng)者，俯瞰天下。這是一個恃強(qiáng)凌弱的世界，人們以武道修為來定等級論高低。各大門派為了爭奪最強(qiáng)之名，一直明爭暗斗。在這里，只有強(qiáng)者有權(quán)利生存下去，即使是同族同門之人，若是實(shí)力弱小，也只有被驅(qū)趕欺凌的下場。