明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

生于震那帝國的宋江，是一名正義感和好奇心強烈的采風，在一次際遇中被卷入禁軍的紛爭中，得到“天印”的能力，化險為夷。帝國能源“星石”日漸枯竭，化解這一問題的線索，就藏在震那初代帝王所造的九顆天印中。 帝國太尉高俅聲稱履行帝王的旨意，開始了對天印的強行回收計劃。面對帝國禁軍的異動，反抗帝國的勢力紛紛崛起。江決心要平息這場紛亂，一路上聯(lián)絡志同道合的英豪，率領著以劉武山為據點的反抗軍，開始了討伐高俅。

在孤兒院長大的痞子華一龍在一次斗毆中右眼重傷，接受了眼角膜移植手術后意外獲得了透視眼的特異功能，借此順利考入全國頂尖的北方醫(yī)科大學“臨床醫(yī)學特殊培訓班”（精英天才班），與宿舍四兄弟在醫(yī)學院一同成長的騷鬧熱血故事。在醫(yī)大生活中，各種重口味醫(yī)學課程、學霸與學渣互相比拼、魔鬼教授與調皮學生斗智斗勇，讓華一龍不斷的成長。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時代，述寫新的傳奇。作品獨創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭，此所謂“魂戰(zhàn)紀”。