原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

18歲那年，楚凡斬殺魔族統(tǒng)領(lǐng)，走出封門村，沒(méi)想到卻被白家退婚。得知此事的幾個(gè)師姐，紛紛希望將楚凡拐到自己家中。本以為能夠享受齊人之福，然而楚凡卻發(fā)現(xiàn)，魔族統(tǒng)領(lǐng)，異人，天府，虛空中的玄牝之門，以及周圍飄蕩的神靈尸體，乎都在訴說(shuō)著一件事——這個(gè)世界并沒(méi)有那么簡(jiǎn)單......