很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時(shí)，一位仙人出現(xiàn)，他將妖獸引領(lǐng)到一個(gè)世外秘境，這個(gè)秘境被后人稱(chēng)之為“山海界”。 數(shù)百年過(guò)去了，某一天仙人設(shè)下的結(jié)界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現(xiàn)任守界者靈發(fā)仙人來(lái)到人類(lèi)的世界。然而此時(shí)此刻，孟然和同學(xué)正因?yàn)檎`闖后山而遇到傳說(shuō)中的兇獸窮奇……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

燕赤霞在家門(mén)遭變之后，看透世人的貪嗔欲愛(ài)，決心潛心修道。他的師傅為了試煉他，讓他只身去黑山捉妖。在試煉的過(guò)程中，燕赤霞遇上了不顧他人勸阻夜宿鬼寺的落魄書(shū)生寧采臣，二人成為鄰居。寧采臣偶遇女鬼聶小倩，兩情相悅。但小倩是被樹(shù)妖姥姥控制的鬼魂，專(zhuān)門(mén)迷惑精壯男子代姥姥吸取陽(yáng)氣。寧采臣欲救小倩脫離姥姥魔掌，但苦于姥姥功力深厚，小倩無(wú)法脫離其魔掌。二人遂向燕赤霞求救，一場(chǎng)人鬼大戰(zhàn)就此展開(kāi)……