明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

比喻了一位名叫山脈的少年率領離子化、紡錘形、射電、羽毛、蝴蝶和仙組成了光弧教練的光之隊在宇宙星之飛球大賽的過程，從中遇到了由牙率領的金之隊、拱心環(huán)率領的獸之隊、藍離散率領的矢之隊等等并與光之隊決斗著，最終得到了冠軍。

在未來，渴望具象成現實，面對未知的挑戰(zhàn)，充滿熱情和希望就是真英雄。