身為X組織特工的葉宗秦，大腦突然被轉移到一名叫“明雅”的少女身上，并且被清除了記憶。醒來時竟然卷入到一場生死選拔賽之中！這背后究竟在策劃著怎樣的陰謀，等待著秦的又將會是什么？

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。

車禍身亡的林淵，意外地穿越到了平行世界，并成為了一頭自帶簽到系統(tǒng)的怪獸！在馬里亞納海溝簽到，獎勵“吞噬能力”！在極淵島簽到，獎勵“爆裂吐息”！在極寒冰原簽到，獎勵“紅蓮形態(tài)”！在亞馬遜雨林簽到，獎勵“破壞神形態(tài)”！不過，林淵秉著不無敵就不出世的念頭，在極淵島上默默簽到了三十年……三十年后，外星艦隊進攻地球？黑暗泰坦集齊六顆滅世寶石？異族怪物大舉入侵？黑暗宇宙妄圖覆滅人類文明