這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

小學(xué)老師安傾時(shí)隔九年與初戀對(duì)象易言城再次相遇。當(dāng)年因?yàn)橐淮位┑囊馔猓籽猿浅蔀榱碎g接害死自己姐姐安妮的兇手，安傾雖然只身離開這座城市，但依然沒有放下對(duì)他的感情。重遇時(shí)他已是成功的上市公司總裁，兩人間如同往日般的默契再加上自己的學(xué)生趙奇奇的有意撮合之下，他們很快又再次走到了一起。然而阻擋在安傾戀愛之路上的還有很多阻礙，未婚妻葉小姐，家人的不接受，如同巨石一般壓在她的心頭，一次又一次的擾亂她的生活。

女主陽(yáng)蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽(yáng)蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習(xí)語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽(yáng)蘿發(fā)現(xiàn)母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產(chǎn)生了愛的結(jié)晶，生下了自己。陽(yáng)蘿有一半天書血統(tǒng)的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對(duì)陽(yáng)蘿采取了回收行動(dòng)。于是陽(yáng)蘿一邊應(yīng)對(duì)這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。