原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

看起來有點(diǎn)“娘”的男生藺文佳，在COSPLAY時(shí)無意間竟然召喚出了妖狐妲己，妲己經(jīng)常不聽話還喜歡調(diào)戲藺文佳，非常看不起主人懦弱的娘炮性格。與此同時(shí)藺文佳還遭到了同校學(xué)姐的追殺，原來這一切都是因?yàn)樗w內(nèi)蘊(yùn)藏著遠(yuǎn)古神秘一族的“遺骨”，具有最純正的具現(xiàn)師的血統(tǒng)，可以通過cos具現(xiàn)出任何逝去的英魂使之出現(xiàn)在這個(gè)時(shí)空并可以將其變成卡片，可以無限制的具現(xiàn)逝去的英魂戰(zhàn)姬。