明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥靈對(duì)話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁的同時(shí)也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

世間萬家燈火，每一扇門后的每一個(gè)人都有一個(gè)只屬于自己的故事，這個(gè)故事也許是和家人有關(guān)，也許是朋友或同事。也許很多人和你一起見證了這個(gè)故事，也許從始至終都只有你自己知道這個(gè)故事。這個(gè)故事也許溫馨的令人懷念，也許殘酷的讓人無法承受。雖然你我不曾親生經(jīng)歷過，但是它一定在某個(gè)不為人知的地方發(fā)生過……

所羅門之王用來與魔界進(jìn)行交易的魔界金幣送落到世界各地，貪婪的人們用金幣換取了各種具有五花八門功能的魔界道具肆意妄為，世界因此變得混亂不堪。有一天，突然出現(xiàn)了收集這些金幣的二人組。在魔界號(hào)稱最強(qiáng)的魔人福克？巴爾賽巴布，被天真善良的人類少女艾米麗召喚到人間界，并強(qiáng)制簽訂了服從契約，為了早日回到魔界成為王，福克斯不得不協(xié)助艾米麗將所有金幣送回魔界。立場(chǎng)完全不同的兩人，為了各自的目的，一起踏上了旅途。