原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

這個(gè)世界上有著許多從遠(yuǎn)古流傳下來(lái)的“裂縫”，這些裂縫是人界與靈界之間的通道。普通的人類并不具備看到或通過(guò)裂縫的能力，但裂縫那邊的精靈可以。 于是在幾百年前，為了保持兩界平衡，人界出現(xiàn)了一個(gè)叫裂縫管理者的家族，他們的任務(wù)就是封印裂縫、驅(qū)逐精靈。

女主陽(yáng)蘿目睹母親被吸入一本天書(shū)，為了尋回母親，陽(yáng)蘿開(kāi)始四處收集天書(shū)，并在“藏書(shū)閣”昴和男主人公習(xí)語(yǔ)的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書(shū)越多，陽(yáng)蘿發(fā)現(xiàn)母親竟然是天書(shū)里面的人物，并與身為人類的父親產(chǎn)生了愛(ài)的結(jié)晶，生下了自己。陽(yáng)蘿有一半天書(shū)血統(tǒng)的事瞬間引起了很多藏書(shū)閣的注意，并對(duì)陽(yáng)蘿采取了回收行動(dòng)。于是陽(yáng)蘿一邊應(yīng)對(duì)這些藏書(shū)閣，一邊加快速度收集天書(shū)。