公元前265年，司馬昭病逝，其子司馬炎繼位。取代曹奐，把國號改為晉，是為晉武帝。晉武帝率領(lǐng)軍隊滅東吳，東吳最后一位君王孫皓被迫投降。至此三國鼎立局面徹底結(jié)束，西晉，這個長達(dá)短暫統(tǒng)治51年，混論紛爭的年代，就這樣，拉開了序幕

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

故事講述了六扇門名捕葉菩提與同伴寒漠屢破驚險奇案的推理冒險故事和破獲匪夷所思的案件的驚險歷程。離奇飛頭疑案環(huán)環(huán)相扣，帥哥美女偶像偵探掉入陰謀迷局。一個個匪夷所思的案件，看似毫無關(guān)系，實則環(huán)環(huán)相扣；十大迷局一場陰謀，迷局背后的大主角身份成迷，臥底陷阱錯綜復(fù)雜、真假難辨的迷團(tuán)，看似毫無關(guān)系的案件背后實則環(huán)陷阱重重，不到最后誰都不知道陰謀的真相……

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。