這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

在與現(xiàn)實世界極為相似的平行世界里，虛擬現(xiàn)實技術(shù)極度發(fā)達，一群在現(xiàn)實中身份各異的少年，進入了名為尋找公主的虛擬現(xiàn)實游戲中，并在游戲中成為了朋友。殊不知這是一款由掌權(quán)者打造的，一款專門用于選拔的游戲。孩子們在游戲種產(chǎn)生的數(shù)據(jù)會被電腦計算，篩選，最終選出智力，力量等各方面異于常人的潛力孩子，被選出的孩子將在特攻學(xué)院中進行特殊培訓(xùn)，最終之戰(zhàn)將在現(xiàn)實展開。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。