明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

車(chē)禍身亡的林淵，意外地穿越到了平行世界，并成為了一頭自帶簽到系統(tǒng)的怪獸！在馬里亞納海溝簽到，獎(jiǎng)勵(lì)“吞噬能力”！在極淵島簽到，獎(jiǎng)勵(lì)“爆裂吐息”！在極寒冰原簽到，獎(jiǎng)勵(lì)“紅蓮形態(tài)”！在亞馬遜雨林簽到，獎(jiǎng)勵(lì)“破壞神形態(tài)”！不過(guò)，林淵秉著不無(wú)敵就不出世的念頭，在極淵島上默默簽到了三十年……三十年后，外星艦隊(duì)進(jìn)攻地球？黑暗泰坦集齊六顆滅世寶石？異族怪物大舉入侵？黑暗宇宙妄圖覆滅人類文明

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據(jù)現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時(shí)代，述寫(xiě)新的傳奇。作品獨(dú)創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關(guān)系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來(lái)的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭(zhēng)，此所謂“魂戰(zhàn)紀(jì)”。